通过u盘检查电脑问题-(通过u盘检查电脑问题)

来源:191路由网 2022-12-13 08:52:56

通过u盘检查电脑问题 (通过u盘检查电脑问题)

博雯 发自 凹非寺

量子位 报道 | 公众号 QbitAI

现在,你也可以像黑客帝国里的Neo一样,查看构成自己和别人的“源代码”了。

方法也非常简单,将体液滴到这样一个大号的“U盘”上:

然后连线插进电脑,再配合软件使用,就能近乎实时地查看你的DNA测序结果了:

毕竟现实中的我们并不生活在矩阵(Matrix)里,也不是由代码组成。

但作为人体生长发育“配方”的DNA序列,某种程度上就相当于一个人的“源代码”了。

而理论上,上述的这一方法甚至能在6小时内对超过1.6亿个碱基进行测序,速度非常快。

这是怎么做到的?

从把DNA“拉丝”并推进一个纳米尺寸大小的孔洞里开始:

将DNA“拉丝”进洞

这是一种叫做纳米孔测序 (Nanopore sequencing)的技术。

在这种方法里,未知序列的样品会被输送穿过一个直径1纳米的小孔。

以人类体液为样本,需要先利用酶“拉开”DNA分子的“拉链”,让一根单链进入纳米孔:

纳米孔所在的生物系统会泡在电解质溶液中,并被施以空间匀强电场。

DNA在核酸外切酶的作用下被迅速逐一切割成单个碱基分子,在电场的驱使下通过纳米孔,此时,就会形成可检测的离子电流。

不同碱基的化学性质不同,这也就使得整条DNA链会在穿越纳米孔引起幅度不同的电流变化。

而这种电流信号的强弱,就能反映DNA样本的核酸序列信息。

电脑

具体而言,每一个DNA片段都就会返回一个基于核苷酸变化的电压读数。

当然,这种反映并不直观,还需要通过一种类似NLP的算法逻辑,将含有噪声的电信号转化为碱基识别的序列数据。

这种方法比起传统的基因测序方法,比如NGS来说,速度要更快,而且对变异结构的检测也更准确。

给电脑插个“U盘”就能看

而从牛津大学衍生而出的Oxford Nanopore公司,就将上述核心技术打包,塞进了这样一个尺寸10厘米的“U盘”之中:

这一产品叫做MinION,使用时需要将自己的体液滴到指定位置。

然后再用一根线将其与电脑连接,再安装产品相应的软件,此外载无需任何设置。

然后,就能在电脑屏幕上看到数据采集、实时分析和运行反馈、本地基本通信和数据流:

根据官方的数据,理论上最大输出速度可达到420个碱基/秒,而从一个单元格中的样本最多可得到50GB的数据,准确率达到88%以上。

除了对专业的研究人员售卖以外,官方的简介中也表明,“没有大量实验室经验的人群也可使用”。

电脑

完整的产品包售价1000美元,折合人民币约6370元。

对于这一产品,有人觉得非常有趣,对于学校或者一些个人开发者来说无疑降低了技术门槛。

也有网友吐槽这只是“听起来很酷”,毕竟除非测序的对象是一个鸡蛋,否则得到的任何序列都只是你全体DNA的一个小子集而已。

最近,还有一位来自霍普金斯大学的教授基于这一产品做了进一步的开发,提出了一个叫做UNCALLED的程序。

在面对大型序列时,这一软件将序列内容与已知的基因序列进行匹配,快速挑选出所需的目标序列。

举个例子,研究人员想要确定一个人是否携带了遗传性癌症相关基因的变异(比如 BRCA1),就可以使用这一软件快速判断当前样本是否值得研究。

电脑

论文:
https://www.nature.com/articles/s41587-020-0731-9

开源下载:
https://github.com/skovaka/UNCALLED

参考链接:
[1]https://stackoverflow.blog/2021/12/24/sequencing-your-dna-with-a-usb-dongle-and-open-source-code/
[2]https://news.ycombinator.com/item?id=29695013
[3]https://www.extremetech.com/extreme/190409-minion-usb-stick-gene-sequencer-finally-comes-to-market

— 完 —

量子位 QbitAI · 头条号签约

关注我们,第一时间获知前沿科技动态


电脑
点击展开全文

相关阅读

通过u盘检查电脑问题-(通过u盘检查电脑问题)

通过u盘检查电脑问题(通过u盘检查电脑问题)博雯发自凹非寺量子位报道|公众号QbitAI现在,你也可以像黑客帝国里的Neo一样,查看构成自己和别人的“源代码”了。方法也非常简单,将体液滴到这样一个大号的“U盘”上:然...

2022-12-13

win7打开显示器黑屏只有鼠标-(win7开机显示器黑屏只有鼠标)

win7打开显示器黑屏只有鼠标电脑(win7开机显示器黑屏只有鼠标)很多用户在使用win7系统过程中遇到黑屏故障,有的是开机黑屏但还能看到鼠标,接下来给大家介绍win7启动黑屏只显示鼠标解决步骤。1、使用“Ctrl+Alt+Del”组合键打开任务管理器,如下图所示:电脑2、点击“文件—新建任务”,在弹出的“新建任务”窗口中输入“explorer”命令后点击确定,如下图所示:3、使用“win+r”...

2022-12-13

win7系统安装千牛死机-()

win7系统安装千牛死机()2015-07-1505:33:00作者:王治阳自苹果第一代iOS系统到现在经历了好几个年头,在过去的几代iOS系统历程中,苹果发布正式版之前都会通过开发者Beta测试版来改进每一代系统的问题。转眼间到了2...

2022-12-13

u盘内存怎么回复-(u盘内存怎么恢复)

u盘内存怎么回复(u盘内存怎么恢复)U盘作为移动办公利器,常被用来储存日常办公文件资料,或数据转移工具。但在使用过程中,U盘的文件突然消失不见,不是被隐藏,也没有中病毒。多次插拔U盘也没有用,电脑都能正常识别U盘,但就是没有任何文件。电脑在电脑端点击查看U盘...

2022-12-13

进入pe系统后u盘不显示硬盘-()

进入pe系统后u盘不显示硬盘()电脑我们都知道pe系统是重装系统和修复系统的操作环境,但是有时候进入pe系统会发现,系统内看不到我们的硬盘。不管是在软件内还是“我的电脑”内都无法显示硬盘盘符,没有硬盘显示,我们便无法对系统进行所需要的操作。pe下看不到硬盘这情况一般发生在新买的电脑上,接下来就给大家提供winpe下无法显...

2022-12-13

191路由网 - 192.168.1.1,192.168.0.1无线路由器设置教程

版权声明:本站的文章和图片来自互联网收集,仅做分享之用如有侵权请联系站长,我们将在24小时内删除