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1、FAT32格式兼容性好，但不支持4GB以上的文件

FAT32格式是Windows平台的传统文件格式，任何USB存储设备都会预装该文件系统，平台上使用Windows 95第二版首次引入，为了取代FAT16(支持文件最大容量2GB)，兼容性很好。

FAT32格式主要的缺陷是只能支持最大单文件大小容量为4GB，由于很多大型游戏、镜像文件、压缩包、视频的文件比较大，FAT32格式是没有办法的。

现在格式化U盘的时候，FAT32仍然是默认操作，Windows 10也是如此，更多是出于兼容性的保守考虑。

2、NTFS格式支持大容量文件和超大分区，但对闪盘芯片有伤害

Windows平台目前应用最广泛的格式，也是目前最好的，支持大容量文件和超大分区，而且有很多高级技术，包括长文件名、压缩分区、事件追踪、文件索引、高容错性、数据保护和恢复、加密访问等等。

但是，NTFS仍然是针对机械硬盘设计的，会记录详细的硬盘读写操作，因此对于闪存会有很大的负担和伤害，容易影响寿命。

因为NTFS分区是采用“日志式”的文件系统，闪存储存芯片读写次数是有限的，使用日志式文件系统的话，需要记录详细的读写操作。大量的小文件读写对于U盘的伤害是极大的，会缩短U盘寿命。